Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grin2cQ01098 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms