Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb2Q00977 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms