Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms