Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SeleQ00690 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SeleQ00690 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeleQ00690 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeleQ00690 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeleQ00690 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeleQ00690 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeleQ00690 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SeleQ00690 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms