Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GabpaQ00422 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms