Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou1f1Q00286 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou1f1Q00286 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms