Protein–RNA interactions for Protein: P98192

Gnpat, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GnpatP98192 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GnpatP98192 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GnpatP98192 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GnpatP98192 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GnpatP98192 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GnpatP98192 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GnpatP98192 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GnpatP98192 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GnpatP98192 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GnpatP98192 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GnpatP98192 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GnpatP98192 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GnpatP98192 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GnpatP98192 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GnpatP98192 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GnpatP98192 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GnpatP98192 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GnpatP98192 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GnpatP98192 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GnpatP98192 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GnpatP98192 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GnpatP98192 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms