Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cds1P98191 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cds1P98191 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cds1P98191 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cds1P98191 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cds1P98191 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cds1P98191 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cds1P98191 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cds1P98191 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cds1P98191 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cds1P98191 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cds1P98191 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cds1P98191 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cds1P98191 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms