Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama4P97927 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama4P97927 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lama4P97927 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama4P97927 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lama4P97927 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lama4P97927 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lama4P97927 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama4P97927 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lama4P97927 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lama4P97927 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lama4P97927 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lama4P97927 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lama4P97927 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lama4P97927 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lama4P97927 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms