Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AlkP97793 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AlkP97793 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AlkP97793 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AlkP97793 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AlkP97793 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AlkP97793 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AlkP97793 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AlkP97793 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AlkP97793 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AlkP97793 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AlkP97793 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AlkP97793 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AlkP97793 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
AlkP97793 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
AlkP97793 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
AlkP97793 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
AlkP97793 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AlkP97793 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AlkP97793 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AlkP97793 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AlkP97793 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AlkP97793 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AlkP97793 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AlkP97793 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
AlkP97793 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AlkP97793 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
AlkP97793 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AlkP97793 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AlkP97793 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AlkP97793 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AlkP97793 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
AlkP97793 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AlkP97793 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AlkP97793 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AlkP97793 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AlkP97793 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AlkP97793 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AlkP97793 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AlkP97793 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AlkP97793 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AlkP97793 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AlkP97793 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
AlkP97793 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
AlkP97793 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AlkP97793 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AlkP97793 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AlkP97793 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AlkP97793 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AlkP97793 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AlkP97793 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AlkP97793 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AlkP97793 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
AlkP97793 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AlkP97793 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AlkP97793 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AlkP97793 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AlkP97793 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AlkP97793 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AlkP97793 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AlkP97793 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
AlkP97793 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AlkP97793 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AlkP97793 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
AlkP97793 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AlkP97793 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AlkP97793 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AlkP97793 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AlkP97793 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
AlkP97793 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AlkP97793 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
AlkP97793 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
AlkP97793 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AlkP97793 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AlkP97793 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AlkP97793 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AlkP97793 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AlkP97793 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AlkP97793 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AlkP97793 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AlkP97793 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AlkP97793 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AlkP97793 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AlkP97793 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AlkP97793 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AlkP97793 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AlkP97793 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AlkP97793 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AlkP97793 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AlkP97793 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AlkP97793 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AlkP97793 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AlkP97793 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
AlkP97793 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AlkP97793 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AlkP97793 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AlkP97793 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AlkP97793 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AlkP97793 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AlkP97793 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms