Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Npas1P97459 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas1P97459 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas1P97459 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas1P97459 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas1P97459 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Npas1P97459 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Npas1P97459 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas1P97459 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms