Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx2P81066 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irx2P81066 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx2P81066 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx2P81066 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irx2P81066 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irx2P81066 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms