Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx2P80206 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx2P80206 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otx2P80206 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx2P80206 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otx2P80206 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otx2P80206 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otx2P80206 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms