Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CiitaP79621 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CiitaP79621 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CiitaP79621 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CiitaP79621 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CiitaP79621 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CiitaP79621 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CiitaP79621 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CiitaP79621 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CiitaP79621 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CiitaP79621 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiitaP79621 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiitaP79621 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiitaP79621 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiitaP79621 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiitaP79621 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiitaP79621 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiitaP79621 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiitaP79621 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiitaP79621 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiitaP79621 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CiitaP79621 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CiitaP79621 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiitaP79621 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiitaP79621 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiitaP79621 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CiitaP79621 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CiitaP79621 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CiitaP79621 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CiitaP79621 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CiitaP79621 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CiitaP79621 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CiitaP79621 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CiitaP79621 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CiitaP79621 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CiitaP79621 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CiitaP79621 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CiitaP79621 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CiitaP79621 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms