Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Q6P79568 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms