Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Polr1bP70700 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Polr1bP70700 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms