Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp9xP70398 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp9xP70398 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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