Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf11P70378 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms