Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ufd1P70362 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms