Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad1P70340 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad1P70340 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad1P70340 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smad1P70340 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms