Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp7P70280 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp7P70280 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp7P70280 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms