Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdlim4P70271 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms