Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtgdrP70263 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtgdrP70263 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtgdrP70263 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtgdrP70263 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtgdrP70263 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgdrP70263 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgdrP70263 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgdrP70263 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgdrP70263 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PtgdrP70263 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtgdrP70263 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtgdrP70263 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtgdrP70263 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgdrP70263 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgdrP70263 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtgdrP70263 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgdrP70263 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgdrP70263 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgdrP70263 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgdrP70263 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgdrP70263 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgdrP70263 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtgdrP70263 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtgdrP70263 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgdrP70263 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgdrP70263 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PtgdrP70263 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgdrP70263 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgdrP70263 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtgdrP70263 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgdrP70263 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtgdrP70263 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgdrP70263 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtgdrP70263 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgdrP70263 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgdrP70263 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgdrP70263 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgdrP70263 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtgdrP70263 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgdrP70263 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgdrP70263 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtgdrP70263 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtgdrP70263 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtgdrP70263 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgdrP70263 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtgdrP70263 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtgdrP70263 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtgdrP70263 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtgdrP70263 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
PtgdrP70263 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtgdrP70263 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtgdrP70263 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtgdrP70263 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtgdrP70263 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtgdrP70263 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtgdrP70263 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtgdrP70263 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtgdrP70263 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtgdrP70263 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PtgdrP70263 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PtgdrP70263 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtgdrP70263 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtgdrP70263 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtgdrP70263 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms