Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DccP70211 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DccP70211 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DccP70211 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DccP70211 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DccP70211 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DccP70211 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DccP70211 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DccP70211 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DccP70211 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DccP70211 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DccP70211 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DccP70211 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DccP70211 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DccP70211 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DccP70211 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DccP70211 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DccP70211 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DccP70211 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DccP70211 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DccP70211 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DccP70211 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DccP70211 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DccP70211 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DccP70211 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DccP70211 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DccP70211 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DccP70211 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DccP70211 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DccP70211 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DccP70211 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DccP70211 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DccP70211 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DccP70211 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DccP70211 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DccP70211 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DccP70211 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DccP70211 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DccP70211 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DccP70211 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DccP70211 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DccP70211 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DccP70211 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DccP70211 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DccP70211 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DccP70211 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DccP70211 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DccP70211 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DccP70211 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DccP70211 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DccP70211 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DccP70211 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DccP70211 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DccP70211 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DccP70211 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DccP70211 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DccP70211 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DccP70211 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DccP70211 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DccP70211 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DccP70211 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DccP70211 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DccP70211 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DccP70211 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DccP70211 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DccP70211 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DccP70211 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DccP70211 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DccP70211 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DccP70211 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DccP70211 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DccP70211 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DccP70211 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DccP70211 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DccP70211 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DccP70211 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DccP70211 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DccP70211 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DccP70211 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DccP70211 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DccP70211 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DccP70211 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DccP70211 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DccP70211 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DccP70211 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DccP70211 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DccP70211 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DccP70211 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DccP70211 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DccP70211 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DccP70211 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DccP70211 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DccP70211 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DccP70211 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DccP70211 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DccP70211 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DccP70211 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DccP70211 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DccP70211 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DccP70211 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms