Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrig1P70193 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig1P70193 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms