Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf5P70191 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf5P70191 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf5P70191 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf5P70191 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf5P70191 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf5P70191 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf5P70191 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf5P70191 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf5P70191 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf5P70191 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Traf5P70191 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf5P70191 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf5P70191 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms