Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb4bP68372 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb4bP68372 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms