Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtnP63089 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtnP63089 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtnP63089 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtnP63089 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PtnP63089 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtnP63089 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtnP63089 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtnP63089 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtnP63089 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtnP63089 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtnP63089 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtnP63089 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtnP63089 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtnP63089 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtnP63089 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtnP63089 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtnP63089 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtnP63089 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtnP63089 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtnP63089 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtnP63089 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtnP63089 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtnP63089 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtnP63089 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtnP63089 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtnP63089 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtnP63089 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtnP63089 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtnP63089 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtnP63089 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtnP63089 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtnP63089 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtnP63089 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtnP63089 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtnP63089 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtnP63089 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtnP63089 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtnP63089 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtnP63089 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtnP63089 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtnP63089 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtnP63089 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtnP63089 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtnP63089 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtnP63089 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtnP63089 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtnP63089 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtnP63089 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtnP63089 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtnP63089 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtnP63089 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtnP63089 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtnP63089 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtnP63089 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtnP63089 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtnP63089 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtnP63089 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtnP63089 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtnP63089 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtnP63089 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtnP63089 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtnP63089 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtnP63089 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtnP63089 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtnP63089 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtnP63089 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtnP63089 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtnP63089 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtnP63089 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtnP63089 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtnP63089 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtnP63089 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtnP63089 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtnP63089 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtnP63089 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtnP63089 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtnP63089 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtnP63089 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtnP63089 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtnP63089 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtnP63089 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtnP63089 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtnP63089 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtnP63089 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtnP63089 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtnP63089 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtnP63089 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtnP63089 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtnP63089 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtnP63089 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtnP63089 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtnP63089 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtnP63089 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtnP63089 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtnP63089 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtnP63089 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtnP63089 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtnP63089 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtnP63089 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms