Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp3P63024 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms