Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrx1P63013 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prrx1P63013 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms