Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnb1P62874 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gnb1P62874 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms