Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps28P62858 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps28P62858 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps28P62858 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms