Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl23P62830 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl23P62830 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms