Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3cP62823 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3cP62823 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms