Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gabra1P62812 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra1P62812 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms