Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm3P62311 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm3P62311 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm3P62311 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm3P62311 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm3P62311 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm3P62311 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm3P62311 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm3P62311 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm3P62311 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm3P62311 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm3P62311 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm3P62311 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm3P62311 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm3P62311 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm3P62311 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm3P62311 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm3P62311 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm3P62311 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm3P62311 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm3P62311 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm3P62311 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm3P62311 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm3P62311 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm3P62311 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lsm3P62311 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm3P62311 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm3P62311 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm3P62311 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lsm3P62311 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms