Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan5P62080 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tspan5P62080 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms