Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms