Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz1P61924 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz1P61924 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz1P61924 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copz1P61924 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copz1P61924 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copz1P61924 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz1P61924 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz1P61924 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz1P61924 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz1P61924 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz1P61924 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz1P61924 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz1P61924 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms