Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Depdc5P61460 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Depdc5P61460 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Depdc5P61460 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms