Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Smg6P61406 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smg6P61406 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smg6P61406 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Smg6P61406 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smg6P61406 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smg6P61406 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smg6P61406 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smg6P61406 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms