Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psme3P61290 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psme3P61290 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psme3P61290 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psme3P61290 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme3P61290 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme3P61290 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psme3P61290 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms