Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr2fP61219 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr2fP61219 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Polr2fP61219 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr2fP61219 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr2fP61219 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2fP61219 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2fP61219 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2fP61219 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr2fP61219 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms