Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah1aP61092 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah1aP61092 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah1aP61092 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah1aP61092 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Siah1aP61092 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah1aP61092 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah1aP61092 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms