Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia3P60469 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfia3P60469 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfia3P60469 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms