Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcmtd1P59913 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcmtd1P59913 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcmtd1P59913 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms