Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps5P59438 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps5P59438 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps5P59438 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps5P59438 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps5P59438 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps5P59438 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps5P59438 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps5P59438 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hps5P59438 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps5P59438 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps5P59438 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps5P59438 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps5P59438 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps5P59438 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms