Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nphp4P59240 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nphp4P59240 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp4P59240 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms