Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Csrnp3P59055 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Csrnp3P59055 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Csrnp3P59055 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Csrnp3P59055 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms