Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpm2P58774 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpm2P58774 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms